El Pirineo navarro está surcado por multitud de ríos y regatas que modelan el paisaje configurando ecosistemas de gran riqueza. Los sotos fluviales son lugares llenos de vida: garzas, milanos, oropéndolas, martines pescadores y otros pequeños pájaros habitan entre alisos, saúcos, sauces, arces, fresnos y olmos.
Los ríos, además, abastecen de agua, proporcionan energía, y ejercen de ejes y comunicaciones entre los Valles. Los principales son:
Irati
Nace de la confluencia de los ríos Urtxuria y Urbeltza en la Selva de Irati, para embalsar poco después en Irabia, un remanso de agua en el corazón del bosque. Tras atravesar Aezkoa y Oroz Betelu ofreciendo estampas de gran belleza, las aguas del Irati se vuelven a embalsar en el pantano de Itoiz, ya recibidos los aportes del Urrobi y Erro. Después le afluyen el Areta y el Salazar para entrar enseguida en la impresionante garganta de la Foz de Lumbier. Finalmente, tras 88 km, su recorrido termina en el Aragón. Junto con el Arga son los ríos de cabecera más caudalosos de Navarra. La riqueza y buena conservación de sus aguas, junto con la vegetación de su ribera y su población piscícola hacen que este río tenga numeroso cotos de pesca de muerte y sin muerte, así como que esté declarado por normativa europea como L.I.C. (Lugar de Interés Comunitario).
Es, probablemente, el río más usado para aprovechamiento hidroeléctrico, especialmente a partir de la inauguración de la empresa Irati S.A.(1911), que tomó su nombre para bautizar también el tren eléctrico que unía Pamplona con Sangüesa. En esa época se construyó el embalse de Irabia, recrecido en más de cinco ocasiones con el objetivo de garantizar el caudal para el viaje de la madera hacia el aserradero de Ekai.
A lo largo del curso del Irati todavía se puede encontrar gran abundancia de tubos, saltos, tuberías, canales y centrales que hablan de la calidad de estas construcciones.
Arga
Nace en el Quinto Real, cerca del Collado de Urkiaga para reposar después en el embalse de Eugi, ofreciendo una bella imagen junto con el pueblo.
En las orillas del Arga encontramos alisos de espectacular floración primaveral, fresnos, chopos y álamos. Éste río brinda también a los amantes de la pesca especies como la trucha o el barbo.

El Arga es el único de los grandes ríos navarros que discurre en su totalidad por territorio foral a lo largo de sus 145 Kms. de recorrido hasta desembocar el Aragón cerca de Villafranca. Es el río más caudaloso de los ríos de cabecera de Navarra. Paralelo al camino de Santiago, numerosos y bellos puentes medievales lo atraviesan a lo largo de su recorrido.
Eska
Discurre por el centro del valle de Roncal y recibe como afluentes por la derecha a los ríos Ustárroz y Viniés y por la izquierda a los ríos Belagua, Mace y Belabarce. Discurre por los términos de Isaba, Urzainki, Roncal y Burgui, al Sur de la zona de Lakartxela, a 3 kilómetros de Burgui, se adentra en territorio aragonés donde recibe las aguas del torrente Badalona, discurriendo por Salvatierra de Esca y Sigues, desembocando en el Aragón en Venta Carrica.
La mayor aportación de aguas que recibe este río vienen de las nieves de las altas cumbres pirenaicas, si bien la mayor parte de esta agua fluyen hacia la vertiente septentrional del Pirineo. Al igual que los ríos Irati y Salazar, este río fue almadiero, oficio que se recuerda cada año a primeros de mayo en el día de las almadías. La riqueza y buena conservación de sus aguas, junto con la vegetación de su ribera y su población piscícola que esté declarado por normativa europea como L.I.C. (Lugar de Interés Comunitario).
Salazar
Es el principal afluente del río Irati. Se forma por la confluencia de los ríos Zatoia y Anduña en Otsagabia. Recorre y vertebra, de Norte a Sur, el Valle de Salazar, al que da nombre, además del Almiradio de Navascués y Romanzado y Lumbier que atraviesa en su tramo final.
Mantiene unas buenas condiciones para la pesca de la trucha y cerca de la desembocadura en el Irati cuenta con poblaciones importantes del barbo y madrilla. Entre sus numerosos puentes, destacan los de Hornos, Esparza de Salazar, Ustés, Bigüezal y el de las Cabras en Lumbier.
La riqueza y buena conservación de sus aguas, junto con la vegetación de su ribera y su población piscícola que esté declarado por normativa europea como L.I.C. (Lugar de Interés Comunitario).
Erro
Nace en Sorogain, atravesando el valle al que da nombre, recorrerá más de 40 km antes de desembocar en el Irati, cerca de Ayanz (Longuida).
Su serpenteante recorrido atravesando pueblos y bosques ofrece bellísimas estampas paisajísticas en toda época del año
Otros ríos destacados: Urrobi: Nace cerca de Auritz-Burguete y recorre todo el Valle de Arce durante unos 30 km hasta desembocar en el Irati ya en el pantano de Itoiz, en Nagore. Junto con el Irati y el Erro, forman el sistema fluvial declarado L.I.C. (Lugar de Interés Comunitario).
Areta: nace en los montes homónimos, en el Valle de Urraul Alto, al que atraviesa de norte a sur, durante unos 35 km hasta desembocar en el Irati cerca de Rípodas, en Urraul Bajo.
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